能自我複製的小分子如何主宰原始地球?諾瓦克利用演化動態的數學原理,解開生命的起源。
今年3月,諾瓦克進行的「懲罰價值」(value
of punishment)研究引發了一陣騷動。身兼美國哈佛大學數學家及生物學家雙重身分的諾瓦克,當時徵求上百位學生試玩一種電腦遊戲,以10美分來獎勵或懲罰另一個人。大家通常認為,須付出代價的懲罰可促使兩個勢均力敵的對手互相合作,但諾瓦克跟他的同事卻證明這個想法是錯誤的。他們發現,懲罰反而會引起一連串的報復,造成負面且具破壞性的結果,完全沒有好處。懲罰別人的人容易引發衝突並損失財富,最後被淘汰出局。「好人贏得最終的勝利」這個標題倒頗能振奮人心。
諾瓦克以電腦模擬及數字計算讓大家重新思考某個複雜的現象,這其實不是第一次。2002年,他曾經推導出方程式,可預測癌症的形成和擴散,包括轉移的癌症何時出現突變,以及染色體變得不穩定的時間點。1990年代初期,諾瓦克也曾經透過疾病發展模型指出,只有在HIV複製夠快的情況下,病毒品種變異性才會到達某一程度而勝過免疫系統,導致愛滋病。後來,免疫學家證實了他推論的機制。現在,諾瓦克想再次嘗試,運用類似的方式來預測生命起源,他表示,他尤其著重在「由無生物轉變成生物」的過程。
哈佛大學演化動態實驗室裡,牆上的黑板寫滿了方程式。諾瓦克一直努力將生命的起源簡化成最簡單的化學系統,以便用數學算式來描述。他用0和1表示最原始生物體內的化學分子(大多由腺嘌呤、胸腺嘧啶、鳥嘌呤、胞嘧啶或尿嘧啶所構成),在他的系統中,這些單體(monomer)可隨機並自動組合成一連串二進位的資訊。
諾瓦克目前正在研究這個系統的化學動力原理,用它來進一步探討這些二進位的資訊如何繼續延伸。他說在理想狀態下,此基本原理適用於實驗室內單體可自行組合的任何化學系統,他解釋道:「這就如同牛頓定律可說明行星環繞太陽的方式,而與行星內部的構造及成份無關。數學讓我們明白實驗中關鍵且有趣的部份,它描述了可形成的化學系統,而一旦化學系統形成了,演化的起源便呼之欲出。」
真的這麼簡單嗎?現在,諾瓦克的系統還停留在紙筆和電腦階段。以數學表達固然容易,但想在實驗室操作就困難重重了,因為那是在沒有任何酵素或模版的情況下,讓單體自行組合。美國加州大學聖克魯茲分校的分子生物工程學家狄默(David
W. Deamer)表示:「產生核酸的過程不是那麼簡單,當中一定有某種起始原料,但我們對這部份仍不甚了解,也不知道該如何在實驗室不經酵素協助,單靠物理、化學方法來製造出這種原料。」…more
【欲閱讀更豐富內容,請參閱科學人2008年第81期11月號】
|