本作除了基本的難易度選擇、演奏後評分的「一般演奏」模式外，收錄多種遊戲模式，包括「好友演奏會！」模式，只要與親朋好友的PSN帳號成為好友，即可讀取好友演奏過的曲目資料進行合奏，即使獨自在家也能享受合奏樂趣。

另有「客串演奏會！」模式，知名人氣角色「初音未來」、「小精靈」、「哆啦A夢」擔任客串來賓、和玩家一同演奏，依據演出結果客串來賓的台詞和演出也會隨之變化。

「太鼓線上排名戰！」模式則先會進行5場階級審核戰來判定玩家實力，再與同階級其他玩家演奏過的曲目資料進行演奏對決，獲勝將可累積獲勝獎牌和對戰點數進而提升階級排名。

「最佳重播演奏」模式可載入當曲目玩家最佳成績的演奏資料，可比對自己發生失誤的地方、進而挑戰更高分。而「訓練演奏」模式將針對玩家不拿手的部分進行特訓，可利用快轉、倒帶、變更播放速度等徹底練習。

《太鼓之達人 合奏咚咚咚！》繁體中文版最新影片：https://youtu.be/90CL3ceSQU8